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深圳市中醫(yī)院始建于1975年，醫(yī)院占地面積約4萬平方米，醫(yī)療用房面積8.5萬平方米，設住院部和兩個門診部。下屬機構有深圳市中醫(yī)藥研究所、深圳市國際中醫(yī)藥人才培訓中心。醫(yī)院于1995年成為深圳市三級甲等中醫(yī)醫(yī)院;1998年成為廣州中醫(yī)藥大學**非直屬附屬醫(yī)院;2012年成為廣州中醫(yī)藥大學深圳臨床醫(yī)學院。

醫(yī)院現(xiàn)有職工1400余人，衛(wèi)生技術人員中，有正高級職稱150余人，副高級職稱近190人;有享受國務院政府特殊津貼專家4人，市政府特殊津貼專家4人，國家高級師帶徒專家4人，廣東省名中醫(yī)11人，深圳市名中醫(yī)17人，**中醫(yī)10名。擁有博士生導師8名，碩士生導師50余名。擔任**學術團體主任委員1人，副主任委員9人，省級學術團體主任委員4人。目前醫(yī)院年門診量260萬余人次，開放床位700余張，年收治病人近2.5人次，已成為集醫(yī)療、教學、科研、預防、保健、康復為一體的大型綜合性中醫(yī)醫(yī)院。

醫(yī)院重視中醫(yī)內(nèi)涵建設，已形成國家、省、市重點?？铺蓐牐F(xiàn)有衛(wèi)生部國家臨床重點?？平ㄔO單位1個(肝病科);國家中醫(yī)藥管理局重點學科建設項目 2個(中醫(yī)肝膽病學、中醫(yī)腎病學);**中醫(yī)重點?？?個(肝病科、腎病科、針灸科)，**中醫(yī)重點?？平ㄔO單位3個(脾胃?？?、內(nèi)分泌專科、神志?？?;省級中醫(yī)名科4個;省級中醫(yī)重點?？?個;省“十二五”中醫(yī)重點?？平ㄔO項目3個;深圳市優(yōu)勢醫(yī)學重點學科1個，深圳市醫(yī)學重點學科3個;市級中醫(yī)特色專病?？?6個。

醫(yī)院先后成為廣州中醫(yī)藥大學博士后科研流動站研究基地，廣東省和深圳市“博士后創(chuàng)新實踐基地”、“廣東省聯(lián)合培養(yǎng)研究生示范基地”，現(xiàn)有8位博士導師、50多位碩士生導師，有36個臨床教研室，已形成博士、碩士、本科多層次的教學體系。在對外交流方面，醫(yī)院先后與美國Thomas Jefferson 大學、德國Medical Park康復醫(yī)院建立協(xié)作關系，與香港中文大學中醫(yī)學院、香港浸會大學中醫(yī)學院、香港執(zhí)業(yè)中醫(yī)師學會、香港中醫(yī)學會會立中醫(yī)學院、香港國際針灸學院等建立了固定的教學協(xié)作及學術交流關系;醫(yī)院有20多個專業(yè)學術團體掛靠醫(yī)院成立。

醫(yī)院非常重視加強中醫(yī)藥文化建設，開展中醫(yī)“固本強基”工程，培養(yǎng)鐵桿中醫(yī)，樹立"心中有愛，服務有情"的服務理念和"大醫(yī)精誠，懸壺濟世"的醫(yī)德觀，形成和諧的工作氛圍。

醫(yī)院堅持“科教興院”戰(zhàn)略，擁有國家中醫(yī)藥管理局中醫(yī)藥科研三級實驗室——臨床細胞分子生物學實驗室、國家藥物臨床實驗基地(獲認定8個專業(yè))、深圳市民生重點實驗室——針灸現(xiàn)代應用研究實驗室。在研課題100余項，醫(yī)院牽頭承擔“十一五”“十二五”科技重大專項各1項，分中心課題5項;國家自然科學基金科研課題13項、國家人事部留學人員回國資助課題1項;廣東省自然科學基金科研課題9項，國家中醫(yī)藥管理局科研課題10項，廣東省科技計劃項目6項，獲得國家省市科技進步獎20余項。

醫(yī)院先后被授予“國家示范中醫(yī)院”、“廣東省示范中醫(yī)院”、“廣東省百家文明醫(yī)院”、“廣東省文明中醫(yī)院”、“廣東中醫(yī)藥強省項目中醫(yī)名院”“全國中醫(yī)醫(yī)院中醫(yī)藥文化建設示范單位”及“全國衛(wèi)生文化先進單位”等稱號。多次在廣東省省情調(diào)查中心組織的醫(yī)院滿意度和醫(yī)德醫(yī)風測評中名列前茅，被媒體譽為“醫(yī)德醫(yī)風好，醫(yī)療質量高，醫(yī)療費用相對低廉，是市民信得過醫(yī)院”。

醫(yī)院醫(yī)療設備總值超過2億元，大型設備有MRI、螺旋CT機、MS人工肝支持系統(tǒng)等。